1 东北农业大学园艺园林学院, 哈尔滨, 150030; 2 东北农业大学, 农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室, 哈尔滨, 150030;3 东北农业大学农学院, 哈尔滨, 150030
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 8 篇
收稿日期: 2020年06月14日 接受日期: 2020年06月22日 发表日期: 2022年02月07日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 8 篇
收稿日期: 2020年06月14日 接受日期: 2020年06月22日 发表日期: 2022年02月07日
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摘要
类钙调蛋白(calmodulin-like, CML)作为一种重要的 Ca2+传感器,在生长发育和植物胁迫应答中发挥十分重要的作用。本研究基于甜瓜(Cucumis melo L.)基因组数据,利用生物信息学手段对甜瓜 CML 蛋白家族进行鉴定,并对其理化性质、位置信息、基因结构、系统发育及启动子等进行了分析。结果表明,在甜瓜基因组数据中共鉴定到 60 个 CmCML 蛋白基因,含 1~4 个 EF-hand 结构域,不均匀地分布在 12 条染色体上;通过与拟南芥 CMLs 构建进化树分析,CmCML 可被分为 8 个类群,各类群数量不等,与其他植物CML 家族基因在类群划分上具有一定的相似性;在启动子分析中,鉴定到脱落酸、茉莉酸、生长素、赤霉素以及干旱、低温、机械损伤等信号响应顺式作用元件。实时荧光定量结果表明:甜瓜 CML 蛋白家族部分基因表达受尖孢镰刀菌甜瓜专化型诱导,这些结果预示着甜瓜 CML 蛋白家族的转录调控可能参与了甜瓜枯萎病的抗性响应,这为该基因家族各成员的功能鉴定提供理论基础。
关键词
甜瓜;CML;生物信息学;表达分析
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